台灣最大 基因 定 序 公司

公司簡介

Genomics原意為基因體學,本公司以此 Genomics(基龍米克斯) 為名,所謂的基因體學是研究生物的基因體及如何利用基因的一門學問,藉由這些基因資訊的運用與開發,將能解決許多與人類日常生活息息相關的問題,如糧食的增產、新藥的開發、疾病的偵測與治療等。

基龍米克斯公司由周德源教授與周孟賢(現任董事長)父子於民國90年10月創立,周德源教授師承兩次諾貝爾獎得主Fred Sanger,曾擔任中研院水稻基因體中心主持人,代表我國參與國際水稻基因解碼計畫,率先完成水稻第五對染色體的基因序列分析,並將我國國旗成功掛在水稻第五對染色體上,在國際上享有極高的學術地位。

全台最大商業基因體定序公司,以原有科技服務之深厚基礎,發展精準醫學基因檢測,提供個人化醫療資訊。

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專業熱情的服務團隊

  • 科研服務團隊 : 主要以中研院水稻基因組計畫定序組技術團隊為骨幹,致力於科學研究、產品開發及技術服務。
  • 次世代定序團隊 : 由經驗豐富的次世代定序技術及生物資訊專家所組成的堅強陣容。
  • 臨床醫學團隊 : 結合定序團隊的專業人才與頂尖醫學中心的醫師及研發團隊,合力開發產前、癌症風險管理、癌症用藥指引及個人健康管理相關基因檢測。

國際基因組應用科技大廠 Illumina 成立於 1998 年,總部位在美國加州聖地牙哥,該公司已在全球 115 個國家和地區設有子公司或辦事處,2020 年收入達 32.36 億美元。Illumina 宣佈 2021 年 9 月 1 日起,將在台灣正式成立並營運子公司:因美納(台灣)生物科技股份有限公司。

Illumina 擁有第一款通過 FDA 核准的 NGS 次世代基因定序儀器,在新冠疫情初期即協助中國科學家以 NGS 技術完整解碼全世界第一株新冠病毒基因序列。在台灣的防疫措施上,也協同政府機構合作推動病毒基因定序服務,以用於監測病毒、追溯傳播鏈、以及疫苗開發。

此外 Illumina 也推出 COVIDSeq 試劑套組,可以精準檢測 COVID-19 病毒存在及確認病毒變異株。「篩檢」結合「基因定序」是此次新冠防疫的重要手段,事實上,這個策略組合也是精準醫療的發展趨勢,可以廣泛應用於癌症、遺傳性疾病、傳染性疾病篩檢、以及微生物檢測,透過得知基因資訊精準做到疾病預防與合適的治療安排。  

癌症與遺傳性疾病的基因定序

精準醫療仰賴分析大量基因資訊,達到疾病預防與個人化健康管理的目的。在癌症治療領域,Illumina 的癌症篩檢套組、次世代基因定序能夠確認腫瘤基因,比過往以影像辨識腫瘤能更早偵測到癌症發展,也可以作為後續追蹤疾病進展的工具。

Illumina 旗下多項癌症基因檢測套組,類型包含針對特定基因型(如乳癌 BRCA 突變基因),或者廣泛檢測癌症相關基因的檢測套組 CGP(Comprehensive Genomic Profiling),其中針對腫瘤組織及液態生物檢體進行基因檢測的套組 TruSight Oncology 500(TSO 500)可鑑定高達 523 個腫瘤生物標記,診斷癌症包含乳癌、大腸癌、肺癌,也可用來開發伴隨式診斷工具。近期 Illumina 與 MSD(美加地區稱 Merck)宣佈合作開發卵巢癌藥物 Lynparza(Olaparib)的同源重組修復缺失(HRD)基因檢測工具,即會運用 Illumina 的 TSO 500 進行患者的全面性基因組分析。

而在生殖醫學方面,基因篩檢與 NGS 定序也在母嬰健康與遺傳性疾病有許多應用性。例如產前的胚胎著床前基因篩檢(preimplantation genetic screening, PGS),或者非侵入性產前檢測(non-invasive prenatal testing, NIPT),可以針對孕婦不同孕期偵測胚胎或胎兒基因,以提高著床率,並且能及早檢測出胎兒患有遺傳性疾病的基因特徵。

國際基因組學科技大廠落腳台灣,推動精準醫療

隨著個人化與精準醫療漸受重視,基因定序能精確提供疾病與多重基因突變之間的關係。Illumina NGS 高通量基因定序準確度高且所需成本低,不論在新冠防疫,或癌症與遺傳性疾病的篩檢、預後監控、甚至基因治療應用,NGS 定序設備都會是重要推手。

Illumina 全球副總裁兼大中華區總經理李慶表示:「台灣是 Illumina 在全球重要的市場之一,成立新公司展示了 Illumina 對於台灣市場的決心,希望能夠為未來台灣業務的發展提供更好的支援。」

如有合作與諮詢需求,歡迎聯絡 Illumina 台灣分公司()

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延伸閱讀:Illumina 響應國網中心科技抗疫,免費提供新冠病毒基因定序分析服務

延伸閱讀:Delta 變種病毒來勢洶洶!臺灣準備好了嗎?

<本文為企業合作專文>

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新聞動態

圖爾思打造全台最大三代基因定序中心

2020-12-17

台灣最大 基因 定 序 公司
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專注於微生物體學與次世代定序(NGS)技術的圖爾思生技引進先進且最大通量的第三代基因體定序儀,昨(16)日與Pacific Biosciences(PacBio)及Oxford Nanopore Technologies(ONT)二大跨國定序公司共同舉辦產品發布會,挾三代定序儀能夠讀取長片段序列、速度快、準確率高且無需PCR擴增等優勢利基,將聯手擘建全台最大的三代基因定序中心,提供包括科研、臨床甚至是生技醫藥領域,全方位的定序服務,激發台灣在生物技術的新創能量與國際同步、甚至超車。

PacBio與ONT是全球三代基因定序技術的領導廠商,圖爾思一次引進PacBio最新的Sequel IIe與ONT旗下的PromethION,雙平台強勢登場,打造全台最大的三代定序中心,將提供業界跨平台、全方位的專業定序解決方案。透過此次合作,除有助圖爾思透過技術與硬體上的升級、擴充,大舉提升定序服務能量與國際接軌。

圖爾思生技董事長楊志偉表示,公司創立之初即定位為科學家研究的最佳夥伴,提供最強大的科研工具與技術服務解決方案,並期許運用自身的研發能力從科研走向大眾健康產品與基因檢測服務,迎接精準醫療時代的到來。17年前SARS疫情爆發後,研究人員耗時近5個月才找到疑似病原;今年初造成全球大流行的新冠肺炎病毒(Covid-19),僅1個月便確認病原,隨即展開相關治療藥物與疫苗的開發。17年間讓檢測時間大幅縮短的背後關鍵功臣,就是仰賴基因定序技術的與時俱進,得以破解基因密碼。

在人類基因體被完全解碼之後,基因定序技術的演進雖然日新月異,但Covid-19仍暴露出全球對「不明原因」的應變能力仍然不足,存在未被滿足的醫療需求。

圖爾思生技總經理劉君豪指出,圖爾思從初創迄今累績為全台2000間實驗室提供專業服務,發現二代定序已無法滿足日益增長的大規模全基因體定序需求,三代定序技術雖然早在十多年前問世,但受制價格昂貴且準確度不足,市場應用遲遲無法開展。隨著技術演進與定序成本不斷下降,不僅單個鹼基的定序價格將逐步貼近二代定序,準確度亦可達到99%以上。

劉君豪進一步說明,三代定序最大的特點是能夠一次對一條DNA分子進行單分子定序且無需擴增,有效彌補二代定序的缺陷。ONT採取奈米孔單分子定序技術(Nanopore Sequencing),是基於電信號技術,當DNA鹼基通過奈米孔時,使電荷發生變化,透過短暫地影響流過納米孔的電流強度來鑑定鹼基種類。其定序一個鹼基僅需0.002秒,堪稱業界最快最即時,且可以直接對RNA定序,因此能突破過往定序技術上的諸多限制。

(時報資訊 記者郭鴻慧)

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【全文】看好基因定序兆元商機 護國群山助台廠彎道超車

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全球基因定序商機上看兆元,靠著半導體的協助,儀器與定序技術不斷進步,費用將逐年下降。(東方IC)

多年前好萊塢女星安潔莉娜裘莉預防性切除乳房,引起討論的「基因定序」,再度因Covid-19受矚目。專家預言,隨著儀器與定序技術的躍進,費用將逐年下降,未來可像手機一樣普及,商機上看兆元。

本刊調查,這塊大餅早讓半導體與生技業者擦出火花,除全球定序設備龍頭Illumina與晶相光在感測晶片合作多年;前工研院院長李鍾熙創辦體學生技,私下找台積電尋求協助;聯電創投也看好入股行動基因,有護國群山加持,台廠有機會在新一代基因定序彎道超車。

「今日本土新增XX例,這起群聚的基因定序已出爐,是新的BA.2,與以往的群聚有所不同…」每天下午中央流行疫情指揮中心記者會的說明,相信大家並不陌生;透過基因定序,從Alpha、Delta到Omicron,指揮中心得以找出傳播鏈有無關聯,釐清感染源。

簡單來說,透過基因定序可精確分析完整的病毒基因圖譜,但基因定序不只能協助防疫,更在疾病檢測方面大大地發揮作用,幫忙評估每個人對特定疾病的罹患風險機率,使許多疾病可及早發現、精準預防及治療,據此創造可觀商機。

基因定序小辭典(Generation Sequencing)

又稱DNA測序,係透過特殊的技術「讀取」DNA分子上各個鹼基之排列組合,可找出與正常基因的差異,進行基因突變篩檢、癌症用藥指引、病毒診斷等。

基因定序從1990年發明第一代桑格定序法後,歷經三十多年的演進,業者融合光學、微機電、生化、半導體微製程、奈米技術加以改良,目前市場主流為次世代(第二代:又稱NGS)高通量定序技術,也陸續發展出可讀更長片段的第三代單一分子即時定序技術。

定序不同代 應用需求各異

業者表示,目前,基因定序主流是以第一代定序方法為基礎,而開發出的新技術次世代(NGS)基因定序,代表廠商包括Illumina、Thermo Fisher等;其中,Illumina握有全球7成設備市場,另外3成則掌握在Thermo Fisher手裡。為打破兩者壟斷的局面,包括PacBio、Oxford Nanopore等均積極投入第三代定序技術(Third Generation Sequencing),但因為成本高、誤差率待改善等問題,第三代主流技術方向仍未確定。

全球基因定序商機上看兆元,靠著半導體的協助,儀器與定序技術不斷進步,費用將逐年下降。(翻攝自illumina官網)

國內最早的基因檢測服務廠商基龍米克斯總經理江俊奇向本刊表示,不同世代,應用需求並不一樣,所以市場都不會消失。以Covid-19為例,若只想確認DNA上有無新冠病毒株,利用第一代即可;但若想監測Covid-19有哪些變異株,就得讀長一點,數據得多一點,才知病毒從哪一個變到哪一個,這就得靠第二代。至於第三代基因定序,可一次讀取的DNA長度超過1000bp,好處是可以看到更多結構性的基因變異,但也因太長、價格還是偏高,精準度仍需優化,現仍停留在實驗研究階段。

台廠搏勝算 從第三代下手

江俊奇並告訴本刊,基龍米克斯目前與Illumina正合作可驗出液態活檢癌症藥物的檢測服務,做為治療用途或者患者復發監控。而第一代定序市場成熟、競爭穩定,也計畫與客戶共同開發相關的臨床服務,找到屬於自己的利基。

而根據Global Information的資料顯示,全球NGS市場將從2021年的138.2億美元(約新台幣4008億元),增長到2027年的402.5億美元(約新台幣1.17兆元)。單就NGS而言,基因定序產值成長就相當可觀,更不用說,第三代若也大量商業化,餅會變得更大。

顯而易見,與Illumina、Thermo Fisher正面對決,台廠幾乎毫無勝算,若想彎道超車,從第三代基因定序技術下手,或許尚有幾分勝算。也難怪,Illumina一度想利用併購PacBio快速切入第三代市場,力阻潛在競爭者。但無論未來戰局如何變化,Illumina的成功,倒是有些值得台廠借鏡的地方。

本刊調查,2015年在台積電年度技術論壇上,當時Illumina全球營運高級副總裁 Bob Ragusa曾經獲邀出席並表示:「與台積電正合作實現更快、更具成本效益的基因測序晶片,定序成本的目標是降低到1千美元。」

事實上,Illumina不只跟台積電合作,也與台灣其他的半導體業者互動頻繁。Illumina部分感測晶片係由晶相光設計,然後交給力積電12吋晶圓代工。

Illumina獨霸全球次世代基因定序設備市場,將近7成的市占率讓競爭對手備感壓力。(翻攝自illumina臉書)

晶相光發言人簡宏亨處長表示:「因獲得具醫生背景也懂半導體的力積電董事長黃崇仁大力支持,雙方才能牽起這份業務。彼此合作的是中低階機種,一開始,我們因未上市、規模也還不大,並非首選,但客戶很訝異我們在2年內就開發出他們要的感測晶片,這種(生物)晶片相當客製化,開發期長,量雖不像消費性晶片多,成長卻很穩定。」

半導體業者 成為關鍵推手

業界人士表示,截至目前為止,基因定序設備的體積雖然不斷縮小,仍只能置放實驗室。但是,未來20年後,每個人家裡可能都會有一台像「可樂罐」大小的機器,戳戳鼻子或喉嚨,把檢體放置晶片後插進儀器與電腦連線,身體有無異狀馬上獲得解答,而這一切若能實現,半導體技術將是關鍵推手。

PacBio的測序晶片一開始也跟台積電合作,後來雖轉到三星,但因良率下降影響銷售,又轉回台積電。(圖片來源:PacBio官網)

種種跡象顯示,Illumina的成功,台灣半導體業者也有功勞,而將來基因定序要更加普及化,不管是哪家業者,也絕對少不了台灣半導體「助拳」。這絕非老王賣瓜自賣自誇,業界盛傳,PacBio的測序晶片一開始也跟台積電合作,後來雖轉到三星,但因良率下降影響銷售,又轉回台積電。

遺憾的是,基因定序在台灣發展二十多年來,業者多走代理服務,意即購買設備、耗材(試劑)、生物標記專利(marker)做檢測;長期下來,因缺乏平台主導權,發展大大受限。

前工研院院長、體學生技創辦人李鍾熙(右),積極投入第三代基因定序設備,想藉此改變目前市場生態。

有鑑於此,前工研院院長、體學生技創辦人李鍾熙想打破這樣的局面。走進體學位於竹北生醫園區的辦公室,李鍾熙帶著本刊記者到機台測試間一探基因定序的奧妙。他請同仁示範測序流程,說明所謂的基因定序,是把ACTG四種鹼基利用螢光顏色標記,在比一根頭髮還小至少500倍的反應槽裡,一個個透過酵素拼接定位。

看似簡單的測序,因鹼基非肉眼能見,所以每個奈米孔下的反應井都有高達百萬以上的通量(在單位時間內,流過單位面積的某種物理量的值),為提高抗雜訊接收準確率,體學使用輝達(nVidia)的繪圖晶片(GPU)。李鍾熙說,目前初讀良率92%,之後還會不斷提高,要到99%才算好。

技術再突破 檢體縮至晶片

在工研院時期,李鍾熙曾大力協助台積電成為台灣科技產業火車頭;卸下院長後,李鍾熙於2010、2012年陸續創辦了體學與奎克生技,其中的體學,瞄準最新一代基因定序,欲借重半導體技術,替台灣開創一條不一樣的路;十二年磨一劍,體學今年底將有1台雛型機對外問世,力圖撼動Illumina的龍頭地位。

「Illumina對基因定序產業貢獻很大,檢測業者利用它的平台,開發針對癌症或醫學等各種用途的應用,平台開發難度很高、挑戰大,Illumina就像台積電在晶圓代工之於半導體,影響力大。」李鍾熙這樣評論競爭對手。

李鍾熙道出創立體學的初衷:「設備是基因定序的核心,也是推動技術進步、成本下降的前端關鍵。12年前,他看到Illumina已在次世代基因定序設備市場席捲全球,心想空間已不大,為了讓台灣在精準醫療取得更多主導權,直接投入第三代基因定序設備,填補這一塊缺口。」

「我們打算借重台灣半導體產業的研發技術,把檢體縮小到晶片上,比起放在顯微鏡,更方便、更快速。」李鍾熙向本刊透露,帶領體學開發產品的過程中,早發現檯面上的定序設備廠跟半導體業者多有合作,如Illumina高階機種的定序晶片自己研發,但生產找上台積電,Thermo Filsher也與台積電、格芯(GlobalFoundry)有業務往來。

Thermo Fisher等基因定序設備商,嘗試透過晶片技術的協助,縮短檢測時間及降低成本。(圖片來源:Thermo Fisher Scientific官網)

其實,不少台灣半導體業者也很關注體學的發展。前旺宏董事長胡定華是體學創辦人之一,據了解,胡定華無預警過世的前一天,甚至還在體學會議室開會。此外,世界先進董事長方略也曾主動遞出橄欖枝,親自前往體學了解相關技術。而或許是看上體學與台灣半導體界的淵源,PacBio也曾找過體學詢問合作的可能。

業界盛傳,體學晶片將由台積電生產。對此,李鍾熙不予回應,只表示目前體學已建立二百多個專利,拉高競爭門檻,終極目標,是讓基因定序從3、4天的檢測時間,大幅縮短為1、2小時,並使檢測成本降為100美元。

看著體學想在定序設備占有一席之地,生物技術開發中心副執行長張綺芬表達認同與肯定。不過,她認為有電子業幫忙,基因定序發展越來越快,不再只能單純靠平台技術取勝。台灣若要走出來自己的路,不能只有可樂罐大小的儀器,更重要的是罐裡裝了什麼?測序數據如何跟臨床整合後分析?台灣業者也該要有開發應用(試劑)的能力。

體學之外,台灣還有許多在基因定序產業鏈中,試圖打響國際名號的企業,行動基因就是其中之一。

行動基因是台廠少數自建DNA文庫、試劑開發與判讀團隊的檢測業者,所以獲得聯電創投青睞入股。圖為行動基因執行長陳華鍵

行動基因執行長陳華鍵與技術長陳淑貞,早期在長庚醫院從事基因定序研究,體認到「判讀」才是精準醫療的目標,且DNA文庫需自行累積,故成立行動基因。陳華鍵向本刊表示,行動基因癌症檢體可一次檢測高達440個基因,公司也研發出相對應的試劑,內部更有五十多位數據分析人員可提供判讀報告,全台最大。

取臨床資料 建議開放法規

陳華鍵也表示,因技術能力受肯定,公司獲得聯電創投入股。2018年更取得佳能(Canon)醫療主動技轉,去年又與比利時最大的醫藥試驗中心Cerba Research合資,幫助Cebra取得亞洲用藥市場,並且收購在肺癌檢測領先的香港善覓(Sanomics),持續以成為亞洲的「Foundation Medicine」(全球最大癌細胞基因檢測公司)為目標而努力。

專家指出,政府法規得更加開放,才能讓更多自主生物標記公司提升在精準醫療的國際競爭力。

「基因定序的應用,一定越來越多。」張綺芬認為,除了體學企圖在設備端超車,台灣要在精準醫療打國際盃,關鍵在臨床資料的取得,建議政府更開放法規,才有更多自主生物標記公司,跟著兆元商機百花齊放。

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