Amino acid 分類

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胺基酸是生物學上重要的有機化合物,由胺基(-NH2)和羧基(-COOH)的官能團,以及連到每一個胺基酸的側鏈組成。胺基酸是構成蛋白質的基本單位,賦予蛋白質特定的分子結構形態,使其分子具有生化活性(biochemical activity)。蛋白質是生物體重要的生物活性分子(bioactive molecule),包括催化新陳代謝的酶(又稱「酵素」)。

在人工合成胺基酸成功以前,胺基酸主要來源於蛋白質水解,而天然蛋白質水解所得的胺基酸大多為α-胺基酸,所以在生化領域「胺基酸」默認指α-胺基酸。至於β、γ、δ……ω等的胺基酸在生化研究中用途較少,大都用於有機合成、石油化工、醫療等方面。

不同的胺基酸脫水縮合形成肽(peptide),其縮合產生的醯胺鍵稱肽鍵。肽雖然和蛋白質在化學本質上除了聚合的長度外沒什麼不同,但是往往不像蛋白質有多級構造與特異功能。

基本結構[編輯]

在化學中,胺基酸指的是結構中含有胺基(-NH2 )和羧基(-COOH)的有機化合物。根據胺基連結在羧酸中碳原子的位置,可分為α、β、γ、δ……等等的胺基酸:α胺基酸的胺基和羧基連在同一個碳原子上,β胺基酸的胺基和羧基連在相鄰的碳原子上,以此類推。 在生物學中,胺基酸通常特指α胺基酸,即胺基和羧基直接連接在同一個-CH-結構上的胺基酸,其通式是H2NCHRCOOH(R代表某種有機取代基)。

蛋白質經水解後,即生成20種胺基酸,如甘胺酸(Glycine)、丙胺酸(Alanine)、纈胺酸(Valine)、亮胺酸(Leucine)、異亮胺酸(Isoleucine)、苯丙胺酸(Phenylalanine)、色胺酸(Tryptophan)、酪胺酸(Tyrosine)、天門冬胺酸(Aspartate)、組織胺酸(Histidine)、天門冬醯胺(Asparagine)、麩胺酸(Glutamate)、賴胺酸(Lysine)、谷胺醯胺(Glutamine)、甲硫胺酸(Methionine)、精胺酸(Arginine)、絲胺酸(Serine)、蘇胺酸(Threonine)、半胱胺酸(Cysteine)、脯胺酸(Proline)等等。

分類[編輯]

根據其結合基團不同。可分為脂肪族胺基酸、芳香族胺基酸、雜環胺基酸、無環胺基酸(acyclic)、鹼性胺基酸、含硫胺基酸、含羥基(醇)胺基酸、含碘胺基酸等。

理化特性[編輯]

Amino acid 分類

  1. 都是無色結晶。熔點約在230℃以上,熔融時分解並放出CO2;都能溶於強酸或強鹼溶液中,除胱胺酸、酪胺酸、二碘甲狀腺素外,均易溶於水;除脯胺酸和羥脯胺酸外,均難溶於乙醇和乙醚。
  2. 具有兩性。有鹼性[二元胺基一元羧酸,例如賴胺酸(lysine)];酸性[一元胺基二元羧酸,例如穀胺酸(Glutamic acid)];中性[一元胺基一元羧酸,例如丙胺酸(Alanine)]三種類型。大多數胺基酸都呈顯不同程度的酸性或鹼性,呈顯中性的較少。所以既能與酸結合成鹽,也能與鹼結合成鹽。
  3. 除甘胺酸外,因不對稱碳的關係,胺基酸呈旋光性。特別地,在生物化學上,以甘油醛為基準依分子的絕對構型又分:D型和L型。組成天然蛋白質的胺基酸,都屬L型。

構成天然蛋白質的20種常見胺酸列表[編輯]

縮寫 縮寫 全名 中文譯名 結構 支鏈 分子量 等電點解離常數
(羧基)
解離常數
(胺基)
pKr(R) 其他
A Ala Alanine 丙胺酸
Amino acid 分類
疏水性 89.09 6.11 2.35 9.87
C Cys Cysteine 半胱胺酸
Amino acid 分類
親水性 121.16 5.05 1.92 10.70 8.37
D Asp Aspartate 天門冬胺酸
Amino acid 分類
酸性 133.10 2.85 1.99 9.90 3.90
E Glu Glutamate 麩胺酸
Amino acid 分類
酸性 147.13 3.15 2.10 9.47 4.07
F Phe Phenylalanine 苯丙胺酸
Amino acid 分類
疏水性 165.19 5.49 2.20 9.31
G Gly Glycine 甘胺酸
Amino acid 分類
疏水性 75.07 6.06 2.35 9.78 沒有旋光性
H His Histidine 組胺酸
Amino acid 分類
鹼性 155.16 7.60 1.80 9.33 6.04
I Ile Isoleucine 異白胺酸
Amino acid 分類
疏水性 131.17 6.05 2.32 9.76
K Lys Lysine 離胺酸
Amino acid 分類
鹼性 146.19 9.60 2.16 9.06 10.54
L Leu Leucine 白胺酸
Amino acid 分類
疏水性 131.17 6.01 2.33 9.74
M Met Methionine 甲硫胺酸
Amino acid 分類
疏水性 149.21 5.74 2.13 9.28 蛋白質合成時第一個胺基酸,
可能在轉譯過程被移除
N Asn Asparagine 天門冬醯胺
Amino acid 分類
親水性 132.12 5.41 2.14 8.72
P Pro Proline 脯胺酸
Amino acid 分類
疏水性 115.13 6.30 1.95 10.64 會破壞蛋白質α螺旋結構
Q Gln Glutamine 麩醯胺酸
Amino acid 分類
親水性 146.15 5.65 2.17 9.13
R Arg Arginine 精胺酸
Amino acid 分類
鹼性 174.20 10.76 1.82 8.99 12.48
S Ser Serine 絲胺酸
Amino acid 分類
親水性 105.09 5.68 2.19 9.21
T Thr Threonine 蘇胺酸
Amino acid 分類
親水性 119.12 5.60 2.09 9.10
V Val Valine 纈胺酸
Amino acid 分類
疏水性 117.15 6.00 2.39 9.74
W Trp Tryptophan 色胺酸
Amino acid 分類
疏水性 204.23 5.89 2.46 9.41
Y Tyr Tyrosine 酪胺酸
Amino acid 分類
親水性 181.19 5.64 2.20 9.21 10.46

標準胺基酸[編輯]

共20種,是組成生命體中的蛋白質的主要單元,第21和第22種胺基酸,硒半胱胺酸和吡咯賴胺酸,分別用通常的終止密碼子UGA和UAG編碼,出現在少數蛋白質中。

主要化學性質[編輯]

以下的分子量是根據各元素的同位素在自然界的豐度所做的平均值。此外由於形成肽鍵時,會減少一個水分子,因此蛋白質中單一胺基酸的分子量,比下表數值少了18.01524 Da。

胺基酸 分子量(Da) pIpK1(α-COOH) pK2(α-+NH3)
丙胺酸89.09404 6.01 2.35 9.87
半胱胺酸121.15404 5.05 1.92 10.70
硒半胱胺酸169.06
天冬胺酸133.10384 2.85 1.99 9.90
谷胺酸147.13074 3.15 2.10 9.47
苯丙胺酸165.19184 5.49 2.20 9.31
甘胺酸75.06714 6.06 2.35 9.78
組胺酸155.15634 7.60 1.80 9.33
異亮胺酸131.17464 6.05 2.32 9.76
賴胺酸146.18934 9.60 2.16 9.06
吡咯賴胺酸255.31
亮胺酸131.17464 6.01 2.33 9.74
甲硫胺酸149.20784 5.74 2.13 9.28
天冬醯胺132.11904 5.41 2.14 8.72
脯胺酸115.13194 6.30 1.95 10.64
谷胺醯胺146.14594 5.65 2.17 9.13
精胺酸174.20274 10.76 1.82 8.99
絲胺酸105.09344 5.68 2.19 9.21
蘇胺酸119.12034 5.60 2.09 9.10
纈胺酸117.14784 6.00 2.39 9.74
色胺酸204.22844 5.89 2.46 9.41
酪胺酸181.19124 5.64 2.20 9.21

支鏈性質[編輯]

以下列表中的pKa值,可能與這些胺基酸在蛋白質內部時有所不同。

胺基酸 支鏈 疏水性pKa 極性電荷芳香族
或脂肪族
范德瓦爾斯半徑
丙胺酸-CH3 X - - - - 67
半胱胺酸-CH2SH X 8.18 - 酸性 - 86
硒半胱胺酸-CH2SeH X 5.73 - - -
天冬胺酸-CH2COOH - 3.90 X 酸性 - 91
穀胺酸-CH2CH2COOH - 4.07 X 酸性 - 109
苯丙胺酸-CH2C6H5 X - - - 芳香性 135
甘胺酸-H X - - - - 48
組胺酸-CH2-C3H3N2 - 6.04 X 弱鹼性 芳香性 118
異亮胺酸-CH(CH3)CH2CH3 X - - - 脂肪性 124
離胺酸-(CH2)4NH2 - 10.54 X 鹼性 - 135
吡咯賴胺酸-C12H21N3O3
亮胺酸-CH2CH(CH3)2 X - - - 脂肪性 124
甲硫胺酸-CH2CH2SCH3 X - - - - 124
天冬醯胺-CH2CONH2 - - X - - 96
脯胺酸-CH2CH2CH2- X - - - - 90
穀胺醯胺-CH2CH2CONH2 - - X - - 114
精胺酸-(CH2)3NH-C(NH)NH2 - 12.48 X 鹼性 - 148
絲胺酸-CH2OH - - X - - 73
蘇胺酸-CH(OH)CH3 - - X 弱酸性 - 93
纈胺酸-CH(CH3)2 X - - - 脂肪性 105
色胺酸-CH2-C8H6N X - - - 芳香性 163
酪胺酸-CH2-C6H4OH X 10.46 X - 芳香性 141

基因表現與生物化學[編輯]

胺基酸 短寫 縮寫 密碼子在蛋白質中
出現頻率(%)
對人類的必需性
丙胺酸A Ala GCU, GCC, GCA, GCG 7.8 -
半胱胺酸C Cys UGU, UGC 1.9 -
硒半胱胺酸U Sec UGA -
天冬胺酸D Asp GAU, GAC 5.3 -
穀胺酸E Glu GAA, GAG 6.3 -
苯丙胺酸F Phe UUU, UUC 3.9 X
甘胺酸G Gly GGU, GGC, GGA, GGG 7.2 -
組胺酸H His CAU, CAC 2.3 -
異亮胺酸I Ile AUU, AUC, AUA 5.3 X
離胺酸K Lys AAA, AAG 5.9 X
吡咯賴胺酸O Pyl UAG
亮胺酸L Leu UUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG 9.1 X
甲硫胺酸M Met AUG 2.3 X
天冬醯胺N Asn AAU, AAC 4.3 -
脯胺酸P Pro CCU, CCC, CCA, CCG 5.2 -
穀醯胺 Q Gln CAA, CAG 4.2 -
精胺酸R Arg CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG 5.1 -
絲胺酸S Ser UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC 6.8 -
蘇胺酸T Thr ACU, ACC, ACA, ACG 5.9 X
纈胺酸V Val GUU, GUC, GUA, GUG 6.6 X
色胺酸W Trp UGG 1.4 X
酪胺酸Y Tyr UAU, UAC 3.2 -
終止編碼 - Term UAA, UAG, UGA - -

必需胺基酸[編輯]

人體能消化吸收以及利用的胺基酸只有20種。其中有8種胺基酸(嬰兒為9種)是成人體內不能合成或合成速度不能滿足機體的需要,必須從膳食補充的胺基酸稱為必需胺基酸(EAA),即亮胺酸、異亮胺酸、纈胺酸、甲硫胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、蘇胺酸、賴胺酸,組胺酸為小兒生長發育期間的必需胺基酸,胱胺酸、酪胺酸、牛磺酸為早產兒所必需。其他14種非必需胺基酸可以用葡萄糖或是別的礦物質來源製造。

肉類中的蛋白質是完全蛋白質,可以提供人體所需的全部胺基酸種類,瘦豬肉的蛋白質含量約為10%至17%,肥豬肉則只有2.2%;瘦牛肉為20%左右,肥牛肉為15.1%;瘦羊肉17.3%,肥羊肉9.3%;兔肉21.2%;雞肉23.3%;鴨肉16.5%;鵝肉10.8%。肉類的蛋白質經過烹調,有一部分會散在肉湯中,也有一部分水解成胺基酸,溶於肉湯裡,故烹調好的肉湯味道鮮美而富於營養。

次要編碼胺基酸[編輯]

通常的中止密碼子UGA和UAG編碼的胺基酸,出現在少數蛋白質中。

縮寫 縮寫 全名 中文譯名 結構 支鏈 分子量 等電點解離常數
(羧基)
解離常數
(胺基)
pKr(R) 其他
U Sec Selenocysteine 硒半胱胺酸
Amino acid 分類
親水性
O Pyl Pyrrolysine 吡咯賴胺酸
Amino acid 分類
鹼性

其它胺基酸[編輯]

  • 胱胺酸
  • 羥脯胺酸
  • 鳥胺酸
  • 瓜胺酸
  • 鵝膏蕈胺酸

參考文獻[編輯]

引用[編輯]

來源[編輯]

  • 人民教育出版社 普通高中課程標準實驗教科書
  • 國立臺灣大學 莊榮輝 生物化學基礎 胺基酸 (頁面存檔備份,存於網際網路檔案館)
  • 國家教育研究院, "臺灣翻譯專業發展與資訊科技",元照出版.

延伸閱讀[編輯]

  • Tymoczko, John L. Protein Composition and Structure. Biochemistry. New York: W. H. Freeman and company. 2012: 28–31. ISBN 9781429229364.
  • Doolittle RF. Redundancies in protein sequences. Fasman GD (編). Predictions of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation. New York: Plenum Press. 1989: 599–623. ISBN 978-0-306-43131-9. LCCN 89008555.
  • Nelson, David L.; Cox, Michael M. Lehninger Principles of Biochemistry 3rd. Worth Publishers. 2000. ISBN 978-1-57259-153-0. LCCN 99049137.
  • Meierhenrich, Uwe. Amino acids and the asymmetry of life (PDF). Berlin: Springer Verlag. 2008. ISBN 978-3-540-76885-2. LCCN 2008930865. (原始內容 (PDF)存檔於12 January 2012).

參閱[編輯]

  • 胺基酸的化學反應
  • 蛋白質

外部連結[編輯]

  • Amino acid 分類
    維基共享資源上的相關多媒體資源:胺基酸

編碼胺基酸

一般主題

  • 蛋白質
  • 遺傳密碼

Amino acid 分類

以性質分

脂肪族

  • 支鏈胺基酸
    • 纈胺酸
    • 異白胺酸
    • 白胺酸
  • 甲硫胺酸
  • 丙胺酸
  • 脯胺酸
  • 甘胺酸

芳香族

  • 苯丙胺酸
  • 酪胺酸
  • 色胺酸
  • 組胺酸

極性不帶電

  • 天門冬醯胺
  • 麩醯胺酸
  • 絲胺酸
  • 蘇胺酸

帶正電(pKa)

  • 離胺酸(≈10.8)
  • 精胺酸(≈12.5)
  • 組胺酸(≈6.1)

帶負電(pKa)

  • 天門冬胺酸(≈3.9)
  • 麩胺酸(≈4.1)
  • 半胱胺酸(≈8.3)
  • 酪胺酸(≈10.1)

其他分類方法

  • 必需胺基酸
  • 生酮胺基酸
  • 生糖胺基酸
  • 非蛋白胺基酸

生物化學物質種類索引

醣類

  • 醇類
  • 糖醇
  • 醣蛋白

酯質

  • 類花生酸類
  • 脂肪酸
    • 中間物
  • 甘油酯
  • 磷脂
  • 鞘脂類
  • 膽固醇與類固醇中間產物

核酸

  • 成分
    • 中間物

蛋白質

  • 胺基酸
    • 中間物

其他

  • 四吡咯
    • 中間物

Template:Protein primary structure

代謝:蛋白質代謝 · 胺基酸合成及催化胺基酸合成的酶

生酮胺基酸→
乙醯輔酶A

離胺酸→

  • 酵母胺酸去氫酶
  • 戊二醯輔酶A去氫酶

白胺酸→

  • 3-羥基丁醯輔酶A去氫酶
  • 支鏈胺基轉移酶
  • 支鏈α-酮酸去氫酶錯合物
  • 烯醯輔酶A水合酶
  • HMG-CoA解離酶
  • HMG-CoA還原酶
  • 異戊醯輔酶A去氫酶
  • α-酮異己酸雙加氧酶
  • 白胺酸 2,3-胺基變位酶
  • 甲基巴豆醯輔酶A羧化酶
  • 甲基戊烯二醯輔酶A水合酶

色胺酸→

  • 吲哚胺2,3-雙加氧酶/色胺酸2,3-雙加氧酶
  • 芳犬尿胺酸甲醯胺酶
  • 犬尿胺酸酶
  • 3-羥基胺基苯甲酸氧化酶
  • 胺基羧基粘糠酸半醛脫羧酶
  • 胺基粘糠酸半醛去氫酶

苯丙胺酸→酪胺酸→

(見下)

生糖胺基酸

生糖胺基酸→
丙酮酸→
檸檬酸

甘胺酸→
絲胺酸→

  • 絲胺酸羥甲基轉移酶
  • 絲胺酸脫水酶
  • 甘胺酸→肌酸:胍基乙酸N-甲基轉移酶
  • 肌酸激酶

丙胺酸→

  • 丙胺酸轉胺酶

半胱胺酸→

  • D-半胱胺酸脫巰基酶

蘇胺酸→

  • L-蘇胺酸去氫酶

生糖胺基酸→
穀胺酸→
α-酮戊二酸

組胺酸→

  • 組胺酸解胺酶
  • 尿刊酸水合酶
  • 胺亞甲基四氫葉酸環化去氫酶

脯胺酸→

  • 脯胺酸氧化酶
  • 吡咯啉-5-羧酸還原酶
  • 1-吡咯啉-5-羧酸去氫酶/醛去氫酶4A1
  • 吡咯啉-5-羧酸還原酶1

精胺酸→

  • 鳥胺酸轉胺酶
  • 鳥胺酸脫羧酶
  • 鯡精胺酶

→α-酮戊二酸鹽→TCA

  • 穀胺酸去氫酶

其它

  • 半胱胺酸 + 穀胺酸鹽→
    麩胱甘肽:γ-穀胺酸半胱胺酸合成酶
  • 麩胱甘肽合成酶
  • γ-麩胺醯轉肽酶
  • 穀胺酸鹽→麩醯胺酸:麩醯胺酸合成酶
  • 麩醯胺酸酶

生糖胺基酸→
丙醯輔酶A→
琥珀醯輔酶A

纈胺酸→

  • 支鏈胺基轉移酶
  • 支鏈α-酮酸去氫酶錯合物
  • 烯醯輔酶A水合酶
  • 3-羥異丁醯-輔酶A水解酶
  • 3-羥基異丁酸去氫酶
  • 半醛去氫酶

異白胺酸→

  • 支鏈胺基轉移酶
  • 支鏈α-酮酸去氫酶錯合物
  • 3-羥基-2-甲基丁烷基-輔酶A去氫酶

甲硫胺酸→

  • 高半胱胺酸的產生: 甲硫胺酸腺苷轉移酶
  • 腺苷高半胱胺酸酶
  • 甲硫胺酸的再生: 甲硫胺酸合成酶/高半胱胺酸甲基轉移酶
  • 甜菜鹼高半胱胺酸甲基轉移酶
  • 到半胱胺酸的轉化: 胱硫醚-β-合成酶
  • 胱硫醚-γ-解離酶

蘇胺酸→

  • 蘇胺酸醛縮酶

→琥珀醯輔酶A→TCA

  • 丙醯輔酶A羧化酶
  • 甲基丙二酸單醯輔酶A差向異構酶
  • 甲基丙二酸單醯輔酶A變位酶

生糖胺基酸→富馬酸

苯丙胺酸→酪胺酸→

  • 苯丙胺酸羥化酶
  • 酪胺酸轉胺酶
  • 4-羥苯丙酮酸雙加氧酶
  • 尿黑酸-1,2-雙加氧酶
  • 延胡索醯乙醯乙酸水解酶
  • 酪胺酸→黑色素:酪胺酸酶

生糖胺基酸→草醯乙酸鹽

天門冬醯胺→天門冬胺酸→

  • 門冬醯胺酶/天門冬醯胺合成酶
  • 天門冬胺酸胺基轉移酶

醫學導航:遺傳代謝缺陷

代謝、k,c/g/r/p/y/i,f/h/s/l/o/e,a/u,n,m

k,cgrp/y/i,f/h/s/l/o/e,au,n,m,人名體徵

藥物(A16/C10)、中間產物(k,c/g/r/p/y/i,f/h/s/o/e,a/u,n,m)

代謝(分解代謝和合成代謝)

主要概念

  • 代謝途徑
  • 代謝網路
  • 基本營養類型

產能代謝
呼吸作用

  • 糖解 → 丙酮酸脫羧 → 三羧酸循環 → 氧化磷酸化(電子傳遞鏈 + 三磷酸腺苷合酶)

無氧呼吸

  • 非氧電子受體

發酵作用

  • 糖解 → 受質級磷酸化
    • 丙酮-丁醇-乙醇發酵
    • 酒精發酵
    • 乳酸發酵

特殊途徑
蛋白質代謝

  • 蛋白質生物合成
  • 蛋白質分解代謝

醣代謝
醣分解代謝
和糖合成代謝)
人類

  • 糖解 ⇄ 糖質新生

  • 肝糖分解 ⇄ 肝糖生成

  • 磷酸戊醣途徑
  • 果糖分解
  • 半乳糖分解

  • 醣基化
    • N-連接醣基化
    • O-連接醣基化

非人類

  • 光合作用
  • 不產氧光合作用
  • 化能合成
  • 碳固定
  • 固氮作用

  • 木糖代謝
  • 輻射營養

脂類代謝
脂類分解脂類合成
脂肪酸代謝

  • 脂肪酸合成
  • 脂肪酸降解
    • α-氧化
    • β-氧化

其他

  • 甾體代謝
  • 鞘脂類代謝
  • 類花生酸代謝
  • 酮症
  • 膽固醇逆轉運

胺基酸

  • 胺基酸合成
  • 尿素循環

核酸代謝

  • 嘌呤代謝
  • 再利用路徑
  • 嘧啶代謝

其他

  • 金屬代謝
    • 鐵代謝
  • 乙醇代謝

醫學導航:遺傳代謝缺陷

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k,cgrp/y/i,f/h/s/l/o/e,au,n,m,人名體徵

藥物(A16/C10)、中間產物(k,c/g/r/p/y/i,f/h/s/o/e,a/u,n,m)

規範控制
Amino acid 分類

  • AAT: 300379425
  • BNF: cb11944322s (data)
  • GND: 4142205-3
  • LCCN: sh85004486
  • NDL: 00560236
  • NKC: ph217172