MWssDNA= NAxMWA+NTxMWT+NCxMWC+NGxMWG+79
注：碱基A，T，C，G的分子量分别是313.2，304.2，289.2 和 329.2 g/mol。这里的79 代表的是5‘单磷酸基团的分子量。
MWssRNA= NAxMWA+NUxMWU+NCxMWC+NGxMWG+159
注：碱基 A，U，C，G 的分子量分别是 329.2，306.2，305.2 和 345.2 g/mol。这里的159 代表的是5’三磷酸基团的分子量。
拷贝数=NA x 摩尔数
注：NA 代表的是阿伏伽德罗常数 6.02x1023。
MWpeptide or protein=AnxMWA+RnxMWR+NnxMWN+…+VnxMWV
注：An，Rn，Nn和Vn 分别指的是丙氨酸，精氨酸，天冬酰胺和缬氨酸的个数。20种基本氨基酸分别用 A，C，D，E，F，G，H，I，K，L，N，P，Q，R，S，T，V，W，Y 表示，其对应的分子量为71.08，103.14，115.09，129.12，147.18，57.06，137.15，113.17，128.18，113.17，131.21，114.11，97.12，128.41，156.20，87.08，101.11，99.14，186.21，163.18 。
ε=（5500xNW+1490xNY+125xNC）M-1 cm-1
注：色氨酸，酪氨酸，半胱氨酸广泛存在于蛋白序列中，所以用这三种氨基酸的消光系数之和代表蛋白质的消光系数。NW、NY和NC分别代表色氨酸，酪氨酸，半胱氨酸的个数；色氨酸，酪氨酸，半胱氨酸的消光系数分别是5500，1490 和 125 M-1 cm-1.
MWformula= N1xMW1+N2xMW2+N3xMW3+…+NnxMWn
注：Nn 代表第n行元素的个数。各元素的相对分子质量请参考元素周期表。
AbMole摩尔浓度计算器是基于以下公式：
质量 (g) = 浓度 (mol/L) x 体积 (L) x 分子量 (g/mol)
| = | x | x |
*制备溶液时，请使用产品标签或MSDS/COA上标识批次的对应分子量进行计算。
AbMole摩尔浓度计算器可以帮助您计算如下信息：
- 配置一定量体积和浓度的溶液时所需化合物的质量
- 使用一定量化合物按指定浓度配置得到的溶液体积
- 使用一定量化合物按指定体积配置得到的溶液浓度
使用AbMole摩尔浓度计算器计算示例
已知化合物的分子量为197.13，如果要配置成10ml浓度为10mM的水溶液，需要多少质量的化合物？
- 在分子量框中输入197.13
- 在浓度框中输入10并选择正确的单位（millimolar）
- 在体积框中输入10并选择正确的单位（milliliter）
- 点击【计算】按钮
- 在质量框中就会出现计算结果19.713 mg
在线计算网 · 发布于 2021-10-12 15:45:06 · 已经有722人使用
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1) 选择分子类型
2) 输入千碱基 (kb):
3)输入兆瓦的kDa (即Kb 或 g/mol/1000):
重量 → 摩尔:
分子
摩尔 → 重量
分子
:
摩尔浓度的计算
in
权重计算的摩尔浓度:
in
1) 选择分子类型 DSDNA; ssDNA RNA olig
2) 输入千碱基 (kb):
3)输入兆瓦的kDa (即Kb 或 g/mol/1000):
寡核苷酸(引物)计算器
该工具计算寡核苷酸的退火温度(Tm)，分子量 (MW), 消光系数(OD/μmol, μg/OD)。
请在下面的文本框中输入寡核苷酸的序列.
1. 寡核苷酸的序列:
全长:0
核酸在260 nm的消光系数
该计算工具基于近邻模型及文献报道的参数1,2. 详细参数可以参见下表，这些参数是在260nm、中性pH条件下获得的。计算得到的消光系数误差在4%左右（260nm，中性pH条件下）.
DNA和RNA寡聚核苷酸的消光系数 [liter/(mol.cm)].
| pdA | 15400 | pA | 15400 |
| pdC | 7400 | pC | 7200 |
| pdG | 11500 | pG | 11500 |
| pdT | 8700 | pU | 9900 |
| dApdA | 27400 | ApA | 27400 |
| dApdC | 21200 | ApC | 21000 |
| dApdG | 25000 | ApG | 25000 |
| dApdT | 22800 | ApU | 24000 |
| dCpdA | 21200 | CpA | 21000 |
| dCpdC | 14600 | CpC | 14200 |
| dCpdG | 18000 | CpG | 17800 |
| dCpdT | 15200 | CpU | 16200 |
| dGpdA | 25200 | GpA | 25200 |
| dGpdC | 17600 | GpC | 17400 |
| dGpdG | 21600 | GpG | 21600 |
| dGpdT | 20000 | GpU | 21200 |
| dTpdA | 23400 | UpA | 24600 |
| dTpdC | 16200 | UpC | 17200 |
| dTpdG | 19000 | UpG | 20000 |
| dTpdT | 16800 | UpU | 19600 |
消光系数通常用来计算核酸分子的浓度（Lambert-Beer law）
浓度(mol/l) = A260nm/(ε * pathlength(cm))
退火温度(Tm) 的计算
对于长度小于14nt的oligo来说，计算公式：3: Tm = (nA + nT)*2 + (nG + nC)*4
对于长度大于13nt的oligo来说，计算公式：Tm= 64.9 +41*(nG + nC - 16.4)/(nA + nT + nG + nC)
公式中n为序列中A,T,C,G各自的数量.
分子量的计算
DNA 分子量 (这里特指合成的DNA引物. 计算过程中假定5'没有单磷酸)
分子量 = (An x 313.21) + (Tn x 304.2) + (Cn x 289.18) + (Gn x 329.21) - 61.96
An, Tn, Cn, 和 Gn 分别是A,T,C,G的数量
References
- 1. Cantor C.R., Warshaw M.M., and Shapiro H. (1970) Oligonucleotide interactions. III. Circular dichroism studies of the conformation of deoxyoligonucleotides, Biopolymers 9, 1059-1077.
- 2. Fasman, G.D. (Ed.) (1975) Handbook of Biochemistry and Molecular Biology, Volume 1: Nucleic Acids, pp 589, 3rd edition, CRC Press.
- 3. MARMUR J, DOTY P. Determination of the base composition of deoxyribonucleic acid from its thermal denaturation temperature. J Mol Biol. 1962
- 4. Wallace,R.B., Shaffer,J., Murphy,R.F., Bonner,J., Hirose,T., and Itakura,K. (1979) Nucleic Acids Res 6:3543-3557